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RNA-Seq在基因表达中的应用

2020-06-16/ 顺河炒股配资 社/ 查看: 214/鑫配资 配资公司 : 10

摘要为了解种子如何变成花朵,或海星如何让失去的肢体再生,基因表达研究都是必需的。基因表达是指遗传蓝图转化
    为了解种子如何变成花朵,或海星如何让失去的肢体再生,基因表达研究都是必需的。基因表达是指遗传蓝图转化成有功能的生物活性元件的过程。通常,由基因编码蛋白质,不过,科学家逐渐了解到,它们也编码大量其他的非蛋白编码元件,如siRNA、tRNA及多种形式的microRNA1。这一系列RNA推动了重要的生物过程,如转录调控、细胞分化,而在失调时,又参与了复杂疾病的发展。

    RNA-Seq带来了一幅高分辨率、逐个碱基的编码和非编码RNA活性视图,提供了特定时刻整个转录组中基因表达的完整图像。尽管RT-PCR和表达芯片可定量表达水平,但RNA-Seq的主要优势在于它能够鉴定转录组的新特征。对于RT-PCR和芯片,基因组中只有已知和之前测序过的区域被探查。而对于RNA-Seq,包括已知和未知的区域在内的整个转录组都被捕获。

    为了解正常细胞的发育和疾病机制,研究人员常常研究发育过程中、特定组织内或不同条件下的差异表达。RNASeq被用于评估基因表达谱,以研究各种复杂疾病,包括心肌病、多发性硬化和代谢疾病。最近人们对患有代谢异常非酒精性脂肪肝(NAFLD)个体的差异表达谱进行分析,鉴定出75个miRNA,其中30个上调,45个下调。通过功能分析,研究人员鉴定出重要通路中的miRNA基因目标,如生长因子β通路和凋亡通路。

    单细胞RNA-Seq已成为干细胞、免疫学和神经生物学研究中的强大工具,可评估细胞的发育和分化。单细胞RNA-Seq曾用在一项以鉴定和构建成年小鼠中视觉皮层细胞分类研究中。根据基因表达特征,不同的细胞类型被鉴定出。那些检测所鉴定细胞的电生理学和轴突投射性质的研究正在进行中。

    参考文献:运用RNA-Seq实现新一代的基因表达谱分析

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